优化的反应化学使强大的,miRNA特异性库,同时最小化反应偏差和消除适配器二聚体.独特的分子指数(UMIS)标记每个miRNA在早期阶段,消除PCR和测序偏差。利用基因全球集成技术方便地分析搁浅的rna-seq数据RNA-seq分析门户-一个直观的、基于网络的数据分析解决方案,为生物学家创建,并包含在QIAseq链RNA库工具包中。
不含凝胶的mirna测序库从1ng的总rna中提取。
消除适配器二聚体和不需要的RNA物种,从而获得最高保真度和最有效的数据
基于珠的消除适配器二聚体和不需要的rna物种的方法
集成独特分子指数(UMIS)使单个miRNA分子的定量成为可能
包括访问rna-seq分析门户供人、鼠和鼠样本使用。
QIAseqmiRNA测序可以通过改进的工作流程生成更好的数据。标准的QIAseq miRNA程序不需要凝胶纯化、切除和洗脱,提供大量的样品处理/丢失和节省时间。
MiRNA测序工作流的一个重大问题是适配器二聚体污染的存在。QIAseq miRNA库工具包已经完全优化了库过程,几乎消除了适配器二聚,即使总RNA的输入非常低。此外,反应化学促进了强大的、以miRNA为中心的库的制备,同时几乎消除了偏见和背景污染物。总之,这些好处突出表明,QIAseq miRNA库工具包旨在最大限度地提高miRNA的可用于序列的产量。
由于循环miRNA作为潜在的生物标记物的生长,QIAseq miRNA文库试剂盒进行了优化,使miRNA降至超低的输入水平。此外,该试剂盒将独特的分子指数(UMIS)集成到反转录过程中,使NGS能够对成熟miRNAs进行无偏和准确的miRNOME范围的定量。总的来说,QIAseqmiRNA提供了一个无与伦比的示例来洞察解决方案,使用下一代测序技术对新的miRNAs进行差异表达分析和发现(见图QIAseqmiRNA工作流)。
生物液(如血清、血浆、脑脊液和尿液)、细胞、新鲜/冷冻组织和含有总RNA和miRNA的FFPE组织与QIAseq miRNA库试剂盒兼容。用QIAseq miRNA来表征下一个循环的miRNA生物标志物。发现锁在FFPE组织中的miRNA信号。完全描述了一个新物种。QIAseqmiRNA文库试剂盒的设计是为了提高诸如血清等生物液体的产量。在miRNA的图形检测中,QIAseq miRNA文库试剂盒对血清样品miRNA的检测具有较强的鲁棒性。然后将映射读取与血清样本中的适配器二聚体进行比较。QIAseqmiRNA即使在有限的样本中仍显示出更优越的miRNAs图谱(见图中在血清样本中的分布)。用QIAseq miRNA文库试剂盒,确定任何已知或新的miRNAs与任何物种的总RNA样本的差异表达。
QIAseqmiRNA是增强发现和表达能力的终极工具,从数百个样本到一个专注于一组目标miRNA的小型试点。QIAseqmiRNA提供了一个无与伦比的样品来洞察解决方案的差异表达分析和发现新的miRNA使用下一代测序。