General description
MABE1144/1132/1133甲基胞嘧啶双加氧酶TET3(C 1.14.11.n2; UniProt O43151)由人TET3(也称为 KIAA0401)基因(基因 ID 200424)编码。TET(10-11易位)蛋白(TET1、TET2和TET3)将5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲酰基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC),为哺乳动物中主动表观遗传DNA脱甲基提供了一种手段。TET蛋白还将基因组胸腺嘧啶残基修饰为5-羟基尿嘧啶。TET蛋白依赖于Fe(II)和2-氧代戊二酸作为活性的辅因子,已知2-氧代戊二酸抑制其活性,而抗坏血酸则显示刺激TET介导的胞嘧啶氧化。此外,翻译后修饰(PTM),例如磷酸化和O-GlcNAc糖基化,也在调节TET蛋白的活性中起作用。发现TET1和TET2在小鼠胚胎干细胞(mESC)中高度表达,并且已知TET3在卵母细胞中上调并氧化沉默的父本原核DNA。还报道了神经元组织中高水平的TET蛋白和基因组5-羟甲基胞嘧啶。研究人员已经报道过三种TET3剪接亚型/变体,长的全长亚型Tet3FL和短的亚型 Tet3s在胚胎干细胞(ESC)向神经元谱系(neuronal lineage)的分化过程中上调,而 Tet3o对卵母细胞有特异性,在ESC或检测的成年小鼠组织的任何其它类型细胞中都没有检测到,表明Tet3o在小鼠受精卵中父系基因组(paternal genome)氧化中的作用。Tet3FL 和Tet3o 含有完整的 Tet3s序列和额外(但不同的)N末端序列。只有Tet3FL含有N末端CXXC结构域,该结构域结合未甲基化CpG并具有**的5caC亲和力。Tet3FL的活性远远低于Tet3o和Tet3s,说明CXXC结构域限制了Tet3FL 5mC 的氧化能力。
计算分子量:193.7/179.4 kDa (人亚型 Tet3FL/Tet3s)、194.8/180.4/185.1 kDa(小鼠亚型 Tet3FL/Tet3s/Tet3o)、166.7/77.47 kDa (UniProt 人亚型2/3)、 76.26 kDa (UniProt 小鼠亚型2)注意,UniProt亚型1(O43151-1/人和Q8BG87-1/小鼠)对应于亚型 Tet3s,而不是Tet3FL(NM_001287491.1/人和JX946278.1/小鼠)。
Immunogen
对应于人TET3 N 末端一半的内部序列的 KLH 偶联线性肽。
Application
免疫沉淀分析:10 µg 代表性批次从 500 µg 转染小鼠胚胎干细胞(mESC)裂解液中免疫沉淀了外源表达的小鼠TET3-GFP融合蛋白。
染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)分析通过ChIP-seq 分析 (每次ChIP10 µg ),采用转染至过度表达小鼠TET3的小鼠胚胎干细胞(mESC)制备的染色质制剂,一个代表性批次检测到 TET3 染色体染色体富集位点(由Reik lab, Epigenetics ISP, Babraham Institute, UK提供)
免疫细胞化学分析:一个代表性批次的1:250稀释液对转染至过度表达小鼠TET3 卵母细胞亚型Tet3o的4%多聚甲醛固定、0.5% Triton X-100-透化的小鼠胚胎干细胞(mESC)进行了免疫染色(由Reik lab, Epigenetics ISP, Babraham Institute, UK提供)
免疫细胞化学分析:一个代表性批次的1:250稀释液在4%多聚甲醛固定、0.5% Triton X-100-透化的小鼠受精卵中检测到TET3 卵母细胞亚型Tet3o的免疫反应性(由Reik lab, Epigenetics ISP, Babraham Institute, UK提供)
免疫沉淀分析:通过RIME(内源蛋白的快速免疫沉淀质谱联用技术),10 µg 代表性批次对内源性 OGT与来自转染小鼠胚胎干细胞(mESC)的外源过表达的鼠TET3进行了免疫共沉淀(由Reik lab, Epigenetics ISP, Babraham Institute, UK提供)。
抗-TET3(货号ABE290)是一种高度特异性的兔多克隆抗体,靶向甲基胞嘧啶双加氧酶TET3 ,并已在染色质免疫沉淀(ChIP)、ChIP-seq、免疫细胞化学、免疫沉淀和蛋白质印迹中进行了测试。
Biochem/physiol Actions
免疫原序列存在于Jin, S.G.等人报道的TET3亚型Tet3FL、Tet3s和Tet3o 剪接亚型(Jin, S.G., et al. (2016).Cell Rep.14(3):493-505),以及UniProt 报道的(O43151, Q8BG87)所有额外的人和小鼠TET3剪接亚型。注意,UniProt亚型1(O43151-1/人和Q8BG87-1/小鼠)对应于亚型 Tet3s,而不是Tet3FL(NM_001287491.1/人和JX946278.1/小鼠)。
Preparation Note
自收到之日起,在2-8°C条件下可稳定保存1年。
Analysis Note
通过蛋白质印迹在小鼠TET3 GFP 融合蛋白中进行了评估。
蛋白质印迹分析:2 µg/mL该抗体在10 µg转染小鼠胚胎干细胞(mESC)裂解物中检测到外源表达的小鼠TET3 GFP融合蛋白。
Other Notes
浓度:请参考特定批次的数据表。
| biological source | rabbit |
| Quality Level | 100 |
| conjugate | unconjugated |
| antibody form | affinity isolated antibody |
| antibody product type | primary antibodies |
| clone | polyclonal |
| purified by | affinity chromatography |
| species reactivity | mouse |
| species reactivity (predicted by homology) | human (based on 100% sequence homology), rat (based on 100% sequence homology), nonhuman primates (based on 100% sequence homology) |
| technique(s) | ChIP: suitable (ChIP-seq),immunocytochemistry: suitable,immunoprecipitation (IP): suitable,western blot: suitable |
| NCBI accession no. | NP_001274420 |
| UniProt accession no. | O43151 |
| shipped in | ambient |
| target post-translational modification | unmodified |
| Gene Information | human ... TET3(200424) |

